MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 7647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017560	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017560	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017560	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017560	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017560	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017560	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017560	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017560	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017560	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017560	T	9	9	5994	6002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017560	CAT	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017560	TAA	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017560	ATA	2	6	6121	6126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017560	GGCT	2	8	6127	6134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017560	TA	4	8	6157	6164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017560	ATT	2	6	6175	6180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017560	TTTA	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017560	TAAA	2	8	6219	6226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017560	TTA	2	6	7504	7509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017560	ATT	2	6	7555	7560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017560	AT	3	6	7581	7586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017560	ACA	2	6	7638	7643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017560	TA	3	6	8734	8739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017560	TAT	2	6	8751	8756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017560	TGACT	2	10	8808	8817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017560	TTA	2	6	8864	8869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017560	TAA	2	6	8905	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017560	ATTT	2	8	8916	8923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017560	TTTA	2	8	8964	8971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017560	GATAC	2	10	8992	9001	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017560	TTA	2	6	9009	9014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017560	A	6	6	9068	9073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017560	ACC	2	6	9082	9087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017560	GTA	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017560	CAT	2	6	9143	9148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017560	ATT	2	6	9156	9161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017560	CAT	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017560	ACA	2	6	9191	9196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017560	TAA	2	6	9200	9205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017560	TATT	2	8	9212	9219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017560	TAAT	2	8	9258	9265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017560	TTA	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017560	ATTTA	2	10	9351	9360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017560	TAT	2	6	9403	9408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017560	AAT	2	6	9453	9458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017560	TAT	2	6	9477	9482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017560	AGA	2	6	11825	11830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017560	ATA	2	6	14382	14387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017560	TTA	2	6	14392	14397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017560	TA	3	6	14404	14409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017560	GTT	2	6	14447	14452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017560	TTA	2	6	14461	14466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017560	GTA	2	6	14478	14483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017560	A	7	7	14483	14489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017560	TAAAC	2	10	14655	14664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017560	ATT	2	6	14679	14684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017560	ATC	2	6	14719	14724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017560	TAAG	2	8	14775	14782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017560	ATTA	2	8	14796	14803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017560	AAG	2	6	14830	14835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017560	AAAG	2	8	14865	14872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017560	A	6	6	14912	14917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017560	ATT	2	6	14940	14945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017560	TTG	2	6	14953	14958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017560	ATT	2	6	14999	15004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017560	AT	3	6	15016	15021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017560	TTAT	2	8	15036	15043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017560	A	7	7	15111	15117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017560	AAG	2	6	15209	15214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017560	TAAG	2	8	15230	15237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017560	ACA	2	6	15283	15288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017560	A	7	7	15293	15299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017560	AGA	2	6	15342	15347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017560	AAT	2	6	15433	15438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017560	ACA	2	6	15484	15489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017560	ATT	2	6	15514	15519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017560	ACT	2	6	15535	15540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017560	TCA	2	6	15583	15588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017560	AATA	2	8	15660	15667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017560	TAG	2	6	15699	15704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017560	AGC	2	6	15707	15712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017560	GTA	2	6	15766	15771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017560	AGT	2	6	15781	15786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017560	GTAA	2	8	15808	15815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017560	TGA	2	6	15828	15833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017560	ATC	2	6	15849	15854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017560	AG	3	6	15862	15867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017560	A	6	6	15890	15895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017560	TAG	2	6	15899	15904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017560	TCAAT	2	10	15906	15915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017560	A	6	6	15948	15953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017560	GAA	2	6	16044	16049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017560	AGCA	2	8	16090	16097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017560	TGA	2	6	16103	16108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017560	AATCA	2	10	16129	16138	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017560	GAA	2	6	16164	16169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017560	A	7	7	16191	16197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017560	TAA	2	6	16202	16207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017560	A	6	6	16211	16216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017560	A	7	7	16238	16244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017560	CTA	2	6	16288	16293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017560	CAA	2	6	16321	16326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017560	GAAGAT	2	12	16362	16373	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017560	TAT	2	6	16528	16533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017560	TAG	2	6	16561	16566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017560	TAC	2	6	16586	16591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017560	ATA	2	6	16639	16644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017560	AATT	2	8	16703	16710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017560	CAG	2	6	16729	16734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017560	A	7	7	16758	16764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017560	AGA	2	6	16775	16780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017560	AGA	2	6	16784	16789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017560	ATC	2	6	16799	16804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017560	CTT	3	9	16843	16851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017560	CAT	2	6	16878	16883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017560	GTT	2	6	16910	16915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017560	TA	3	6	16993	16998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017560	TGA	2	6	17042	17047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017560	AATATA	2	12	17085	17096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017560	ACA	2	6	17120	17125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017560	CAG	2	6	17157	17162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017560	AAAG	2	8	17173	17180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017560	A	6	6	17201	17206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017560	AAG	2	6	17209	17214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017560	GTA	2	6	17217	17222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017560	TTACT	2	10	17228	17237	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017560	ATT	2	6	17259	17264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017560	ATTC	2	8	17266	17273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017560	TAG	2	6	17315	17320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017560	AT	3	6	17326	17331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017560	ATA	2	6	17359	17364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017560	GAT	2	6	17421	17426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017560	GAA	2	6	17487	17492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017560	TA	3	6	17501	17506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017560	ATG	2	6	17545	17550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017560	GAA	2	6	17559	17564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017560	TTA	2	6	17611	17616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017560	AGG	2	6	17638	17643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017560	AAT	2	6	17694	17699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017560	GAA	3	9	17733	17741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017560	AAG	2	6	17749	17754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017560	AAG	2	6	17787	17792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017560	ATT	3	9	17828	17836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017560	A	7	7	17847	17853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017560	GAT	2	6	17870	17875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017560	TAA	2	6	17878	17883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017560	A	7	7	17889	17895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017560	GAA	3	9	17918	17926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017560	TTA	2	6	18069	18074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017560	AAT	2	6	18086	18091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017560	GTA	3	9	18128	18136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017560	GAA	2	6	18149	18154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017560	TAA	2	6	18202	18207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017560	TAA	2	6	18247	18252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017560	AAT	3	9	18284	18292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017560	AAT	2	6	18350	18355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_017560	AT	3	6	18687	18692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017560	TAA	2	6	18748	18753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017560	TTA	2	6	18822	18827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_017560	TCA	2	6	18976	18981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_017560	ATA	2	6	19097	19102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017560	ACC	2	6	19147	19152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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181	NC_017560	TAA	2	6	19257	19262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017560	TCAA	2	8	19685	19692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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288	NC_017560	TAA	2	6	29659	29664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017560	TAA	2	6	29680	29685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017560	TA	3	6	29699	29704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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